Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM179Q6ZVK1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM179Q6ZVK1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms