Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR3Q6ZT12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR3Q6ZT12 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms