Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZRN4Q6ZMN7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms