Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP12Q6UXS9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms