Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A10Q6U841 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms