Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP17L2Q6R6M4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP17L2Q6R6M4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms