Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC174Q6PII3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC174Q6PII3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms