Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms