Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF6Q6KF10 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF6Q6KF10 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms