Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD2Q68DH5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms