Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CREB3L3Q68CJ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CREB3L3Q68CJ9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms