Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CARMIL1Q5VZK9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms