Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLX4IPQ5VYV7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms