Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BROXQ5VW32 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BROXQ5VW32 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms