Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms