Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM78Q5T7P6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM78Q5T7P6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms