Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LDLRAD1Q5T700 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDLRAD1Q5T700 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms