Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NUP188Q5SRE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP188Q5SRE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms