Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRMS1LQ5PSV4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRMS1LQ5PSV4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms