Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms