Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAVIN4Q5BKX8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAVIN4Q5BKX8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms