Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNNI3KQ59H18 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNNI3KQ59H18 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNI3KQ59H18 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms