Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCAF6Q58WW2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCAF6Q58WW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms