Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC92Q53HC0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms