Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC1Q4ZHG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FNDC1Q4ZHG4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms