Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CERKLQ49MI3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CERKLQ49MI3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms