Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NBPF20Q3BBV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF20Q3BBV1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms