Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NBPF1Q3BBV0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms