Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FHOD3Q2V2M9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FHOD3Q2V2M9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms