Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VWC2Q2TAL6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VWC2Q2TAL6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms