Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PARP6Q2NL67 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PARP6Q2NL67 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms