Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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