Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPROQ16827 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPROQ16827 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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