Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFA9Q16795 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NDUFA9Q16795 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms