Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FOXD1Q16676 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOXD1Q16676 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms