Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDK4Q16654 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDK4Q16654 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms