Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC18A3Q16572 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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