Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP35Q16560 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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