Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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LY6EQ16553 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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LY6EQ16553 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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LY6EQ16553 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LY6EQ16553 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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