Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ASIC2Q16515 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms