Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIK5Q16478 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIK5Q16478 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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