Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PRR4Q16378 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PRR4Q16378 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms