Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGA3Q16281 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA3Q16281 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms