Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC6Q16204 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms