Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN1Q15223 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN1Q15223 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms