Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD3Q15054 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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POLD3Q15054 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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POLD3Q15054 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLD3Q15054 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms