Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KARSQ15046 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KARSQ15046 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KARSQ15046 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KARSQ15046 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KARSQ15046 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KARSQ15046 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
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