Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCAPHQ15003 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCAPHQ15003 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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