Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCA4Q14CN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLCA4Q14CN2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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