Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GAPVD1Q14C86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GAPVD1Q14C86 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
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